حفاری تونل خط دو مترو اصفهان به نزدیکی مسجد عتیق رسیده و قرار است از حریم ۳۰ متری آن عبور کند. کنشگران میراث فرهنگی و باستان‌شناسان به تناوب هشدار داده‌اند که عبور مترو از حریم مسجد عتیق این اثر تاریخی را در معرض آسیب قرار می‌دهد. مدیرعامل قطار شهری اصفهان می‌گوید میراث فرهنگی بر عبور مترو از زیرگذر میدان امام علی «صحه» گذاشته است. پیشینه مسجد عتیق اصفهان به دوران باستان بازمی‌گردد. بسیاری آن را موزه معماری ایران می‌نامند.